تقع جمهورية مرتفعات قرة باغ في الجزء الجنوبي الشرقي من منطقة القوقاز الصغرى. يغلب على الجمهورية الطابع الجبلي، تحتضن الجزء الشرقي من هضبة قرة باغ من الغرب ويذهب إلى الجنوب والشرق ، ثم الانضمام مع وادي أرتساخ الذي يُشكل جزءاً كبيراً من الأراضي المنخفضة .